土煙葉特稅的納稅人為收購煙葉的煙草商、運輸商或在產地臨時設莊的商人。土煙葉特稅由主管機關在產地設駐場員或稽征所一次征足。納稅人在售出、運出煙葉前，應報稅務人員驗明煙包，按照市斤逐一過秤后按凈重量征收特稅，并填發完稅照。在本埠銷售的，應報稽征人員，在稅照上加批注明。運銷外埠的，應報明銷售地點，并于煙包上監貼印照、加蓋戳記，方準運銷。由非特稅區域運入的煙葉及煙絲，由入境第一道征稅機關征稅，手續與特稅區域相同。由非特稅區域運入另一非特稅區域，僅經過特稅區域的貨物免于征稅。完稅的煙葉運出或到達他處時，實際重量超過其所完納的稅額，應照章補稅。這是特稅區域內稽征土煙葉特稅規定的通行辦法。
　
　　　甘肅省蘭州市生產的青煙（水煙的一種）是一種特殊情況。青煙又名西煙，運銷路線由產地運到陜西潼關，裝隴海路火車運至江蘇的大浦地區，再轉運上海分銷各地。按土煙葉特稅章程，應由入境第一道特稅機關及河南省陜縣煙酒稅稽征分局征稅。由于鐵路負責運輸，經過陜縣不能稽征。而潼關屬于陜西轄地，河南省陜縣煙酒稅稽征分局不便派員在裝運時稽征，因此矛盾很多。國民黨政府財政部經過研究協調，由河南省陜縣煙酒稅稽征分局在潼關設立駐潼蘭州青煙查驗辦事處，協同陜西第三區煙酒稅稽征分局專辦青煙查驗事務，不征稅款。查明應繳特稅后，到達指定地點，再由主管特稅機關查核征收。為此，河南省印花煙酒稅局擬訂《查驗蘭州青煙裝運入豫填給應納特稅通知單辦法》，經國民黨政府財政部稅務署核準施行。
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　　土煙葉特稅實行后，最初由各省印花煙酒稅局監督征收，在產煙較多或運輸便捷的地點設立土煙特稅分局專辦。如浙江的浙西、蕭山、新昌、松陽，安徽的桐廬，河南的博愛，江西的鄱縣、廣玉等地都設立了土煙葉特稅分局。對出產較少的地區，由各省煙酒稅分局或稽征所征收。如土煙葉出產在開辦薰煙葉統稅的區域，則歸當地統稅管理所征收。湖北的武穴、江西的瑞都、安徽的宿松三地盛產土煙葉，均以江西的九江為運輸集中地。為統一事權，便利征管，國民黨政府財政部特設九江土煙葉特稅辦事處，專管三地的土煙葉特稅，由稅務署直接管轄。湖北省的老河口與河南省的鄧縣是土煙葉主要產地，兩縣產地毗鄰，而鄧縣的土煙葉大多運到湖北，老河口是必經之地。于是援照九江辦法，將鄧縣、老河口兩處歸并，設老河口土煙葉特稅辦事處，負責稽征兩地的土煙葉特稅。起初該辦事處由湖北省印花煙酒稅局兼管，1934年9月改為土煙葉特稅分局，劃歸湖北省印花煙酒稅局直轄。